2021년도 4월 한국생물공학회 교육 워크샵

생물공학, NGS와 Data Processing

1. 교육 목적

한국생물공학회에서는 생물공학 분야 국내 대표학회로 전문인력양성교육 및 생물공학의 산업화를 촉진시키기 위한 산학연 협동으로 매년 교육워크샵을 시행하고 있고 2021년 4월 교육워크샵을 생물공학, NGS와 Data Processing 과정으로 다음과 같이 개설하오니 관심있는 분들의 많은 참가 바랍니다.

2. 교육 개요

○ (교육명) 생물공학, NGS와 Data Processing

○ (일정) 2021년 4월 14일(수) 09:00 ~ 17:20 (4 lessons / 1h 30′씩 진행)

○ (장소) 대면/비대면 혼합

※ 대면 참여는 라마다 제주호텔 2F 그랜드볼룸에서 진행되고 사회적 거리두기 방침에 따라 신청인원을 선착순으로 마감

※ 비대면 참여는 대면강의를 실시간 송출하고 질의에 제약이 있을 수 있음

○ (등록기간) 2021. 3. 10(수) ~ 4. 9(금) 마감

○ (대상) 바이오 분야 재직·연구자, 대학원생

○ (준비물) 노트북 별도 지참 (실습 진행)

3. 교육 신청 방법

○ (신청방법) 온라인으로 교육 신청서 제출 및 등록비 납부

http://www.ksbb.or.kr/conference/edu_workshop/write.html?period=89

○ (등록비) (대면) 150,000원 (비대면) 100,000원 (대면/비대면 참가 중 선택)

○ (수료조건) 교육 시간 80% 이상 수강 시에만 수료증 발급

4. 과정안내 및 문의

(문의처) 한국생물공학회 Tel 02-557-2526, e-mail : ksbb@ksbb.or.kr

5. 프로그램

시 간	교 육 명	연 사
		좌 장 서주현 교수(국민대)
오전 교육
09:00~10:30(90')	주요 NGS 기기의 원리와 활용 예시 (illumina, PacBio, oxford nanopore 등)	전영준 교수(성균관대)
10:45~12:15(90')	리눅스에서의 프로그램 설치 및 구동 & Bash shell programming	김재광 교수(성균관대)
12:15~14:00(105')	점심식사 및 휴식
오후 교육
14:00~15:30(90')	RNA-seq 분석법 (Gene expression analysis, single cell analysis) + 논문 연구	박대찬 교수(아주대)
15:45~17:15(90')	16S rDNA 서열을 이용한 미생물군집(microbiota) 분석 방법	허지원 박사(연세대)
17:15~17:20 (5')	설문조사

※ 상기 프로그램은 학회 진행/연자 사정에 의해 일부 변동될 수 있습니다 (연자 예정안)

※2021 한국생물공학회 춘계학술발표대회 및 국제심포지엄 기간 중 진행되는 유료교육임

6. 교육내용

LESSON 1	2021. 4. 14 (수)		전영준 교수
	09:00~10:30(90')		주요 NGS 기기의 원리와 활용 예시 (illumina, PacBio, oxford nanopore 등)
내용 요약
NGS 기기 및 장비 설명 RNA-Seq library preparation 작동원리와 주의할 사항들 설명 (Sample barcoding strategies, Reversetranscriptase, Stranded vs Unstranded, DNA contamination monitoring, NGS platform comparison.etc)
연사 약력
전영준 교수 jeon2020@skku.edu Assistant Professor, Department of Integrative Biotechnology, College of Biotechnology & Bioengineering, Sungkyunkwan University Professional appointment Postdoctoral research fellow, Stanford university school of medicine (2016-2020) Postdoctoral research fellow, Ohio State University school of medicine (2015-2016) Education MS (Gwangju Institute of Science and Technology) Ph.D. (The Ohio State University) Research Interest A. Liquid biopsy / circulating tumor RNA / NGS B. Precision medicine Cancer recurrence / Drug resistance / Radiation resistance C. Preclinical studies / Cancer cell biology / Lung cancer / metabolic stress / ERAD

LESSON 2	2021. 4. 14 (수)		김재광 교수
	10:45~12:15(90')		리눅스에서의 프로그램 설치 및 구동 & Bash shell programming
내용 요약
- 리눅스에서 프로그램 설치 및 구동 (리눅스 설치, 리눅스의 기본 및 유용한 명령어들, apt-get을 이용한 프로그램 설치 및 구동, source compile을 이용한 프로그램 설치 및 구동, Binary 파일을 통한 프로그램 구동) - Bash shell Programming (argument를 이용한 shell programming, permission 관리, shell script를 이용한 반복, 조건문)
연사약력
김재광 교수 linux@skku.edu Assistant Professor, Department of Applied Artificial Intelligence, School of Convergence, Sungkyunkwan University Education M.S. Sungkyunkwan University(2006) Ph.D. Sungkyunkwan University(2014) Research Interests Recommendation & Prediction System, Intelligent System, Machine Intelligence & Learning, Pattern Analysis, etc. Lab webpage https://sites.google.com/view/skku-milab/

LESSON 3	2021. 4. 14 (수)		박대찬 교수
	14:00~15:30(90')		RNA-seq 분석법 (Gene expression analysis, single cell analysis) + 논문 연구
내용 요약
리눅스를 활용한 RNA-seq 데이터 프로세싱: mapping & 유전자 발현 정량 단세포 전사체 분석: UMI를 통한 정량 & 세포 군집화 분석
연사약력
박대찬 교수 dpark@ajou.ac.kr Assistant Professor, Department of Biological Sciences, Ajou University - Education and training Post-doc, Chemical Engineering, University of Texas at Austin (2016) Ph.D. Genomics and Bioinformatics, University of Texas at Austin (2014) - Experience Assistant Professor, Ajou University, 2018-Present Senior Researcher, Korea Institute of Science and Technology, 2016-2018 - Research Interests Next Generation Sequencing data analysis, Antibody repertoire analysis, Cancer genomics data analysis

LESSON 4	2021. 4. 14 (수)		허지원 박사(연세대)
	15:45~17:15(90')		16S rDNA 서열을 이용한 미생물군집(microbiota) 분석 방법
내용 요약
QIIME2를 활용한 미생물 군집 분석 16S rDNA sequencing data에서 최종 microbial matrix를 얻어내는 과정 미생물 군집 데이터 시각화 R studio를 활용한 미생물 alpha-, beta-diversity 및 통계 분석
연사약력
허지원 박사 jwhuh@yonsei.ac.kr Research Professor, Department of Systems Biology, Yonsei Univeristy Education and training Post-doc, Yonsei Univeristy (2020-Present) Post-doc, POSTECH (2017-2019) Ph.D. POSTECH (2011-2016) Research Intersets Metagenomics Microbiota and gastrointestinal diseases